Die Anwendung der PCR in modernen Laboren ist äußerst vielseitig und reicht von der „einfachen“ PCR über Multiplex-PCR-Methoden, long-PCR und Real Time PCR bis zu komplexen Genexpressionsstudien. Die richtige Planung der PCR sowie die Auswahl der geeigneten Zielsequenzen für die Primer entscheidet dabei oft über Erfolg und Misserfolg der PCR. Dieser Kurs gibt Ihnen eine Anleitung, wie Sie Ihre PCR optimal planen und durchführen.
- Einführung in Sequenzformate
- Datenbanken
- Zielsequenzen und Strategien für das Primer Design
- Primer-Design-Programme
- Planung der PCR und Real Time PCR
- Überprüfung der Primer-Spezifität: BLAST und BLAT Programme
- ClustalX, Bioedit, Primer3, MultiPLX2.0 und FASTPCR.
- Multiplex-PCR
Spezialfälle wie miRNA und die Verwendung von LNA-Primern
Im praktischen Teil arbeiten Sie mit BLAST, Genbank, dokumentieren mittels pDRAW32, alignieren die Sequenzen mit ClustalX und designen Primer mittels Primer3 oder FASTPCR. Gerne können Sie Ihre eigene Fragestellung mit einbringen und bearbeiten.
Zielgruppe
Technische und wissenschaftliche Mitarbeiterinnen und Mitarbeiter mit Grundkenntnissen in der Molekularbiologie und PCR.
Dozent
Dr. Johannes Becker-Follmann studierte Biologie und Philosophie in Saarbrücken und Freiburg. Er promovierte am Institut für Humangenetik und Anthropologie über “Vergleichende Genkartierungen bei Mensch und Maus“. Nach Forschungsaufenthalten in Osaka/Japan, Freiburg und Berlin gründete er im Frühjahr 2000 das Institut für Polymorphismus und Mutationsanalytik in Saarbrücken, das sich hauptsächlich mit der Analyse von DNA verschiedener Spezies beschäftigt. Seit 2002 führt er Schwerpunktseminare und Workshops zu PCR-Themen durch.