Der Kurs beschäftigt sich mit typischen Fragen der PCR und real time PCR Optimierung einschließlich Template-Präparation, sowie der PCR- und real time PCR-Assay Validierung.
Themenschwerpunkte dieses Theoriekurses sind:
- Methoden der Template-Präparation, direct PCR für DNA und RNA, Inhibitoren und verschiedene Kontrollen, interne Prozesskontrolle, Sensitivität
- Optimierung der PCR- und real time PCR: Spezifität, Auswahl der besten Targets
- Primer-Design: 5’Flap-Primer, extrem lange Primer, Mediator-Sonden, dsDNA-Sonden, Genotypisieren mit HRM- und Taqman-Schmelzkurven
- Besprechung von besonderen Sondensystemen auf Nachfrage
- Anwendung des Standard-Additionsverfahrens zur genauen Quantifizierung. lebend/tot-Nachweis
- Validierungsbeispiele, Updates: MIQE-Richtlinien
- Digital PCR/droplet digital PCR, Methoden zur Einzelzell-Analyse
Aktuelle Probleme und Fragestellungen aus dem eigenen Labor können in den Kurs eingebracht werden.
Sie suchen nach Optimierungsmöglichkeiten und Fehlerquellen Ihrer PCR oder Real Time PCR und wollen mehr über die aktuellen Neuigkeiten und Trends auf diesem Gebiet erfahren? Dann sind Sie in diesem Kurs genau richtig!
Ziel im ersten Teil des Kurses ist es, mögliche Fehlerquellen anhand ausgewählter Beispiele zu analysieren und nach Lösungen zu suchen. Im zweiten Teil erhalten Sie Informationen über die neuesten Entwicklungen in der PCR und Real Time PCR.
Auszug aus dem Kursprogramm
Im allgemeinen theoretischen Teil werden u.a. folgende Themen behandelt:
- Fehlerquellen bei der template-Präparation, neue Präparations-Kits
- Optimierung der PCR- und Real Time PCR-Bedingungen
- Methoden zur Steigerung der template Menge vor der RT-qPCR
- Primer-Design Trouble Shooting, Primer-Datenbanken
- Überblick über die Analytik der PCR Produkte
Im zweiten Teil zeigen wir neue Entwicklungen auf:
- Updates: MIQE-Richtlinien, Daten-Analyse, RNA-integrity-Analyse
- Digital PCR/droplet digital PCR, Methoden zur Einzelzell-Analyse
Aktuelle Probleme und Fragestellungen aus dem eigenen Labor können in den Kurs eingebracht werden.
Zielgruppe
Technische und wissenschaftliche Mitarbeiterinnen und Mitarbeiter mit Grundkenntnissen in der Molekularbiologie, die die PCR-Methodik in ihrem Labor optimieren möchten.
Dozent
Dr. Johannes Becker-Follmann studierte Biologie und Philosophie in Saarbrücken und Freiburg. Er promovierte am Institut für Humangenetik und Anthropologie über “Vergleichende Genkartierungen bei Mensch und Maus“. Nach Forschungsaufenthalten in Osaka/Japan, Freiburg und Berlin gründete er im Frühjahr 2000 das Institut für Polymorphismus und Mutationsanalytik Deutschland in Homburg/Saar, das sich hauptsächlich mit der Analyse von DNA verschiedener Spezies beschäftigt. Seit 2002 führt er Schwerpunktseminare und Workshops zu PCR-Themen durch.